Optimiser les bactéries pour la production industrielle

La plateforme d'Ingénierie génétique de DEINOVE s’emploie à optimiser génétiquement les souches bactériennes pour la production d’un composé donné. Cela inclut la modification métabolique des bactéries pour produire de grandes quantités du composé, garantissant ainsi le meilleur rendement de production en aval, ainsi que la résistance des bactéries aux conditions de fermentation à l'échelle industrielle.

Travailler avec des souches bactériennes rares

L'une des limites du travail sur des variantes bactériennes rares est le manque de connaissances sur la façon dont ces organismes peuvent être génétiquement modifiés. DEINOVE a développé une large expérience dans la manipulation et la modification des bactéries du genre Deinococcus et s’appuie sur cette expérience pour traiter maintenant différentes souches bactériennes. Les nouveaux organismes passent par un ensemble de techniques de modification génétique normalisées pour définir, dans un délai de 4 mois, une boîte à outils de méthodes adaptées à chacun d’entre eux.

Une plateforme de génie génétique à haut débit assistée par ordinateur

Les voies métaboliques menant à la production de la plupart des composés sont souvent complexes et impliquent de nombreuses étapes et enzymes différentes. Optimiser une voie métabolique pour produire un composé donné nécessite donc de moduler les niveaux d'expression de plusieurs gènes simultanément. Des milliers de souches avec des différences dans l'expression de ces gènes doivent souvent être construites avant d'obtenir la seule souche présentant la production optimale du composé d'intérêt.

DEINOVE a travaillé en collaboration avec CAD4Bio pour développer un logiciel de conception sur mesure assisté par ordinateur qui conçoit des banques d’ADN combinatoires complexes, génère des instructions d'assemblage et exploite un robot pour une construction à haut débit. Aujourd'hui, DEINOVE est en mesure de produire 1 000 souches bactériennes différentes en un mois. Pour optimiser davantage la construction des souches, le logiciel CAD4Bio a récemment été amélioré avec un module d’apprentissage machine. En utilisant les résultats d'expériences précédentes, il est désormais possible de prédire la faisabilité et la probabilité de succès des constructions futures, réduisant ainsi le temps nécessaire à la génération de souches avec l'équilibre métabolique optimal.

 

Caractéristiques principales

Vaste expérience des techniques de manipulation et de développement des souches Deinococcus, adaptables à de nouveaux organismes rares

Conception génétique assistée par ordinateur avec un module d'apprentissage machine utilisant le logiciel CAD4Bio personnalisé

 

 

Construction de souches automatisée à haut débit

Jusqu'à 1 000 souches produites par mois